- Ninguna de sus obras se ha conservado, pero se conocen gracias a sus discípulos Sinesio de Cirene y Hesiquio de Alejandría, y a referencias de autores posteriores.
- Comentario de la Aritmética de Diofanto.
- Comentario de las Cónicas de Apolonio.
- Comentario (junto a su padre, el también matemático Teón) de los Elementos de Euclides.
- Publicación de un Canon astronómico, unas tablas que permitían calcular el movimiento de los astros de las que no se sabe con certeza si constituyen una revisión de las ideas de Ptolomeo o si, por el contrario, fueron publicadas como una obra independiente. Parece que Hipatia sostuvo tesis arriesgadas en su tiempo, como la del heliocentrismo contra el geocentismo.
Redacción QUO